控根器的內壁有一層特殊薄膜，另外控根器的側壁呈雙面凹凸狀，外部凸出部分留有開孔，可透氣、排水。當種苗的根系在對外向下生長的過程中達到開孔位置或內壁的任何部位時，根尖就會停止生長，接著在根尖后部萌發出3個新根繼續對外向下生長。
由于控根器與所用基質的雙重作用，樹苗的根系可以獲得大量的養分，促進根系著裝生長，足以滿足樹苗定植初期的營養需求，為苗木的成活提供了很多的有利條件。在樹苗移栽過程中，不需要去冠，也不會傷根，使移植不受季節限制，管理程序簡便，成活率高。
果園更新換代至少需要5年時間，采用控根器就可在空閑土地上提前育苗，2-3年內苗木地徑可達4厘米左右、冠徑可達1米以上，已能開花、少量開始結果，移栽時不傷根、不換苗，次年即可大量結果，這樣既能在果園更新期間，果農收入不減，同時又確保苗木品種。
由于控根容器與使用基質的雙重和作用，苗木根系長的壯健，能儲存大量的養分，獲得苗木的定植初期的長的需求，為苗木的成活和長的營造了比較好的情形。
